ただrsyncを書いてあったバックアップスクリプトがげろっとエラー。微妙にUbuntu 10.10からrsyncが3.0.7になっており、受け手の3.0.6に--delete付きは問題が起きますよん、と言われます。どうやらバージョンを合わせるのが筋らしいものの、共有のサーバゆえ…

気分的に1スレッド残し、多少遅くなってもいいからと4スレッド+3スレッドで計算を投入。すると、7スレッドフルに動くとうおーん、とファンが低い音を立て始め、片方が並列でない部分にさしかかると静かに。やはり仮想コアでも、動かしたぶん発熱は増えるよう…

さっきは疑われたHTですが、小さな計算で試したところ、4並列→8並列で約20%性能向上。効果ありでした。テスト系はGromacs 4.0.7 + Lennard-Jones粒子系。ただ、領域分割で並列化されているようなので、8全部使うのはちょっと・・・→7より6のほうが2x3とかで…

遅まきながら、あけましておめでとうございます。 ちまちまといくつかメモ。 まずは先日インストールしたUbuntu 10.10マシンでのGromacsの挙動。年末から計算を放り込んでおいたら、異常に遅い。HTが原因かと思いましたが、ファイルが複数出力されているあた…