遅まきながら、あけましておめでとうございます。
ちまちまといくつかメモ。
まずは先日インストールしたUbuntu 10.10マシンでのGromacsの挙動。年末から計算を放り込んでおいたら、異常に遅い。HTが原因かと思いましたが、ファイルが複数出力されているあたりMPIの加減と判断。いずれもUbuntu 10.04以前な従来のマシンではMPICH2を使用していましたが、今回はOpenMPIにしたら正常動作しました。
インストールの順番などの加減なのか、バージョンの加減なのか。首を突っ込んでいる暇はないので、触らぬ神にたたりなし方式で放置。
